CONTACTS

Thérèse Commes
Responsable plateforme

Tél. 04 67 33 57 11
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Anthony Boureux
Contact plateforme

Tél. 04 67 33 57 14
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Anne RICHARD-VERCHERE
Responsable Valorisation Innovation Partenariat

Tél. 04 67 33 08 12
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Plateformes Recherche

Bio2M : Plateforme Bio-Informatique et Bio-Marqueurs

 

Activité

La Plateforme BIO2M est engagée dans la conception de nouveaux logiciels de traitement rapide des données NGS à grande échelle (outils Open source).
Elle propose une expertise des méthodes d’analyse des données de séquençage haut-débit (NGS).

 

Le professionnalisme de nos équipes et la qualité de nos prestations font de la plateforme BIO2M une référence en Bio-informatique appliquée à l'identification de nouveaux Bio-marqueurs

 

Notre offre

 

Collaboration de recherche ou de R&D

  • Partenariats scientifiques,
  • Réalisation de projets R&D en bio-informatique.


Prestations

  • Analyses NGS quantitatives (RNA-seq, Chip-seq) :   profils d’expression, analyses différentielles, rapports et outils de visualisation,
  • Analyses NGS qualitatives (RNA-seq, Exome) : recherche de SNV ; indels ; variants d’épissage ; ARN de fusion; reconstruction de transcrits ; ARN non codants ...
  • Autres prestations NGS sur devis : développements R&D ciblés, data mining et machine learning, analyses de données en accès public, partage de données (interface Web).


Expertise - conseil

  • Conception et design de projets de séquençage haut-débit (NGS).
  • Proposition et évaluation des outils d’analyses par approche de benchmarking.


Mise à disposition de moyens

  • Mise à disposition d’espace de calcul sur demande.


Formations

  • Organisation de formations pour les biologistes et les bio-informaticiens.
  • Analyse de données NGS et leur exploitation : initiation aux analyses primaires de données NGS, outils d’analyse différentielle, initiation linux...

 

 

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